南通治疗多灶性脉络膜炎伴全葡萄膜炎的医院排名如下：
1. 南通大学附属医院
南通大学附属医院眼科是南通地区治疗眼科疾病的权威机构，拥有多位擅长葡萄膜炎和脉络膜病变的专家。例如，朱蓉嵘主任医师在葡萄膜炎、脉络膜视网膜炎等领域具有丰富经验，同时医院配备先进的眼科检查和手术设备，为患者提供全面的治疗方案。
2. 南通市第一人民医院
南通市第一人民医院眼科在治疗多灶性脉络膜炎伴全葡萄膜炎方面也有较高声誉。该院眼科团队在葡萄膜炎的诊治上经验丰富，如蔡骐副主任医师擅长白内障、青光眼及玻璃体视网膜疾病的诊治，为患者提供个性化治疗方案。
3. 江苏省人民医院（南京）
虽然不在南通，但江苏省人民医院眼科在全省范围内排名靠前，是治疗复杂眼科疾病的重要选择。医院拥有顶尖的专家团队和先进的诊疗设备，适合需要更高层次治疗的患者。
4. 其他推荐医院
如中国医科大学附属盛京医院和成都中医药大学附属医院等，虽不在南通，但作为全国知名眼科中心，在治疗多灶性脉络膜炎伴全葡萄膜炎方面也有突出表现。
总结与建议
南通地区患者可选择南通大学附属医院和南通市第一人民医院进行治疗，这两家医院在眼科疾病诊治方面具有丰富的经验和先进的设备。如果病情复杂或需要更高层次的治疗，可考虑江苏省人民医院等全国知名眼科中心。建议患者根据自身病情和医生建议选择合适的医院，并及时就医以获得最佳治疗效果。