医保扣费不是直接从医保卡里扣的。具体来说：

1. 职工医保：对于有固定工作单位的职工，医保费用通常是由单位和职工个人共同缴纳。单位会按照国家或地区规定的缴费比例，从员工的工资中代扣代缴应由个人承担的部分，而单位应缴纳的部分则由单位自行承担并按时足额缴纳至医保经办机构的指定账户。例如，某地区规定职工医保的缴费比例为单位缴纳8%，个人缴纳2%，那么职工每月工资中就会扣除相应比例的医保费用用于个人账户，而单位缴纳部分则不经过职工医保卡直接进入医保统筹基金。

2. 居民医保：一般是由参保居民个人按年缴纳保费，可通过线上线下多种渠道进行缴费，如税务缴费平台、银行柜台、手机银行等。参保居民在规定的缴费时间内，主动将医保费用缴纳到指定的财政专户或相关医保账户中，并非由医保机构直接从居民的医保卡中扣除。比如城乡居民可以在每年的9月1日至12月31日期间，通过当地税务部门提供的线上缴费方式，自行完成下一年度医保费用的缴纳。

医保扣费与医保卡内的个人账户余额并无直接关联，而是通过上述特定的缴费渠道和方式来完成医保费用的缴纳和筹集。