深圳社保一档、二档、三档的主要区别在于医疗保险，具体差异体现在以下几个方面：

1. 缴费标准不同

• 一档：缴费基数为员工月工资总额，缴费比例为8.2%，其中公司缴纳6.2%，个人缴纳2%3。
• 二档：缴费基数为深圳市上年度在岗职工月平均工资，缴费比例为0.8%，其中公司缴纳0.6%，个人缴纳0.2%3。
• 三档：缴费基数为深圳市上年度在岗职工月平均工资，缴费比例为0.55%，其中公司缴纳0.45%，个人缴纳0.1%3。

2. 就医原则不同

• 一档：可以在深圳市内任意一家定点医疗机构就医，使用医疗保险报销4。
• 二档：门诊在绑定的社康中心才能报销，住院可以在市内任意一家定点医疗机构就医，门诊大病需要在规定的医疗机构就医4。
• 三档：门诊在绑定的社康中心就医，住院及门诊大病在规定医疗机构就医6。

3. 个人账户不同

• 一档：有个人账户，可以用于支付参保人日常普通门诊的医疗费用，也可以在定点药店购买医保目录范围内的非处方药10。
• 二档和三档：没有个人账户，只有统筹账户，不能在药店刷社保卡买药10。

4. 门诊待遇不同

• 一档：社康中心的基本医疗费用，70%由个人账户支付，30%由统筹基金按规定支付5。
• 二档和三档：属于甲类药品和乙类药品的，分别由社区门诊统筹基金按80%和60%的比例支付；属于医保目录的单项诊疗或医用材料的，由社区门诊统筹基金支付90%，最高支付金额不超过120元；社区门诊统筹基金支付年度总额不超过1000元5。

5. 住院待遇不同

• 一档：住院发生的基本医疗费用和地方补充医疗费用起付线以上部分按规定支付95%或90%5。
• 二档和三档：可到绑定的社康中心结算医院住院，或经结算医院转诊到规定医院住院，所发生的基本医疗费用和地方补充医疗费用，报销比例为：一级医院85%；二级医院80%；三级医院75%5。

6. 其他差异

• 生育保险：生育保险不分档，所有参保人的待遇都是一样的9。
• 异地就医：一档参保人普通门诊费用、大病门诊费用、住院费用都可按规定报销；二档和三档参保人普通门诊费用不予报销，符合规定的大病门诊费用和住院费用可按规定报销6。

深圳社保一档、二档、三档的主要区别在于医疗保险的缴费标准、就医原则、个人账户、门诊待遇和住院待遇。一档医保的缴费比例最高，但享受的待遇也最全面，包括可以在任意定点医疗机构就医、有个人账户用于支付医疗费用和购买药品等。二档和三档医保的缴费比例较低，但就医和报销方面有一定的限制。