针对药店医保结算跑单的问题，以下是综合解决方案：

一、立即停止后续交易

1. 停止刷卡或支付

   一旦发现医保结算跑单，应立即停止后续的刷卡或现金支付操作，避免重复扣款或金额累积。

2. 保留交易凭证

   保存好医保卡、药品清单、收据等原始凭证，作为后续协商或投诉的依据。

二、联系医保机构处理

1. 向医保中心报告

   立即通过当地医保中心或健康保险公司提交书面申请，说明跑单具体情况（如药品名称、金额、时间等），请求审核并更正。

2. 提供证明材料

   携带相关凭证到医保大厅办理退费手续。部分医保中心可能要求提供药店与医保系统的对账单或差错证明。

三、与商家协商解决

1. 内部核查

   药店需对医保结算系统进行核查，确认跑单原因（如系统故障、人为操作失误等）。

2. 垫付与退款

   • 若涉及金额较大，建议商家先行垫付差额，待医保审核通过后再退回。

   • 协商重新刷卡结算正确金额，并对跑单事件进行书面说明。

四、其他注意事项

• 时间时效 ：医保退费通常需15个工作日处理，建议尽早申请。

• 责任划分 ：若因药店管理问题导致跑单，可要求商家赔偿差额。

• 预防措施 ：建议定期检查医保刷卡设备，培训员工规范操作流程，避免类似问题再次发生。

五、特殊情况处理

若医保机构或商家拒绝处理，可向当地医疗保障部门投诉（如12333热线），或通过法律途径维权。