咸阳合作医疗在西安的报销比例需根据就医类型、医院等级及是否备案等因素综合确定，具体如下：
一、报销比例分类
住院报销比例
三级医院 ：起付标准至3万元部分，统筹基金支付85%（职工支付15%）；超过3万元至4万元部分，统筹基金支付90%（职工支付10%）；超过4万元部分，统筹基金支付95%（职工支付5%）。
二级医院 ：起付标准至3万元部分，统筹基金支付87%（职工支付13%）；超过3万元至4万元部分，统筹基金支付92%（职工支付8%）；超过4万元部分，统筹基金支付97%（职工支付3%）。
一级医院及家庭病床 ：起付标准至3万元部分，统筹基金支付90%（职工支付10%）；超过3万元至4万元部分，统筹基金支付95%（职工支付5%）；超过4万元部分，统筹基金支付97%（职工支付3%）。
退休人员 ：个人支付比例为职工支付比例的60%。
门诊报销比例
普通门诊 ：按70%比例补偿，每人每日封顶40元，年累计限额140元。
大额门诊 ：起付线2000元，按25%比例补偿，年累计限额2000元。
特殊疾病门诊 ：根据医院级别按45%、35%、15%比例补偿。
二、异地就医政策
备案后报销 ：住院费用按咸阳三类医疗机构标准执行，报销比例较本地降低5%-10%（如三级医院约65%-70%），门诊慢性病与特殊病种同步纳入异地结算。
未备案报销 ：比例下降20%。
目录差异 ：15%的药品及耗材因两地医保目录不同需自费。
三、注意事项
户籍与参保要求 ：若户口已迁至西安，则需参加西安医保，不再适用咸阳新农合。
报销限额 ：门诊年度最高15万元，住院年度最高20万元。
政策差异 ：不同医院、病种及地区可能存在细微差异，建议就医前咨询当地医保部门确认最新政策。
总结 ：咸阳新农合在西安的报销比例需结合医院等级、是否备案及户籍状态综合判断，建议通过正规渠道获取最新政策信息。