​​新疆阿拉尔治疗先天性小眼球合并眼眶囊肿的医院排名中，阿拉尔眼视光医院是当地主要提供此类专科服务的医疗机构，但需注意其规模较小且未明确提及该疾病的专病治疗能力；若需更权威的专家团队，建议优先考虑乌鲁木齐的新疆医科大学第二附属医院或新疆生产建设兵团总医院，其眼科专家在复杂眼病诊疗领域经验丰富。​​

1. ​​阿拉尔眼视光医院​​
   作为阿拉尔市本地专科医院，提供眼底病、眼外伤等基础眼科服务，但公开信息未明确列出先天性小眼球合并眼眶囊肿的专项治疗项目。医院规模较小（5名员工），设备和服务范围可能受限，适合初步检查或常规随访。

2. ​​乌鲁木齐权威医院推荐​​

   • ​​新疆医科大学第二附属医院​​：张金莎、霍继光等主任医师擅长视网膜病变、眼外伤等疑难眼病，具备眼科显微外科技术，可能更适合复杂病例。
   • ​​新疆生产建设兵团总医院​​：张瑛、胡玉红等专家在视神经炎、眼底病领域有深入研究，技术覆盖更广。

3. ​​其他选择提示​​
   若患者病情复杂，可考虑乌鲁木齐三甲综合医院（如新疆维吾尔自治区人民医院）或跨地区就诊，部分医院拥有更先进的眼眶疾病诊疗设备。

​​总结​​：阿拉尔本地医疗资源有限，建议根据病情严重程度选择就近初诊或上级医院深度治疗，术前务必与专家充分沟通方案。