农村医疗在深圳住院可以报销，但具体情况较为复杂，以下是详细介绍：

1. 报销条件

   • 办理转诊备案：一般需要先在县级及以上的医院开具转诊证明，并到当地的社保所作外出治疗的登记，这样才能在深圳的医院进行报销。
   • 符合医保政策规定：参保人需正常缴纳农村医保费用，且住院原因、诊疗项目等符合农村医保政策规定的范围。

2. 报销比例

   • 门槛费以上至3000元的部分：报销比例为88%。
   • 3000元至5000元的部分：报销比例为90%。
   • 5000元以上至最高支付限额内的部分：报销比例为95%。
   • 不同级别的医院：如乡镇级（一级）定点医疗机构住院报销起付线200元，报销比例75%；县级（二级）定点医疗机构住院报销起付线500元，报销比例65%；市级（三级）定点医疗机构住院报销起付线700元，报销比例55%等。

3. 报销流程

   • 患者在深圳住院期间，先自行垫付医疗费用。
   • 出院后，携带相关材料回参保地的农村医保经办机构进行报销。所需材料一般包括患者的身份证、新农合医疗证、病历复印件、住院结算单（发票形式）、住院费用清单、转诊备案手续等。

农村医疗在深圳住院可以报销，但需要满足一定的条件和遵循相应的报销流程。具体的报销比例和额度可能因地区和政策的不同而有所差异，建议在就医前咨询当地医保部门或医院财务部门以获取最准确的信息。