医院处理医疗垃圾的方法如下：
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分类：医院首先会对医疗垃圾进行分类，主要包括感染性废物、病理性废物、损伤性废物、药物性废物和化学性废物。
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收集：各科室应将医疗垃圾分类，分装入垃圾袋内。医疗垃圾袋为黄色，生活垃圾袋为黑色。对已经使用过的一次性注射器、输液器、针头、窥器，按规定先将其毁型后，集中放置在专用袋内。在医疗过程中所产生的其他医疗废物、污物，将其放置在专用污物桶内，外套黄色塑料袋。病人用过的废纸、果皮等废弃物，放置在专用纸篓内，外套黑色塑料袋，不允许扔在地面或走廊内，更不允许扔在窗外。
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转运：医院指定专人每天定时到各科收集医疗垃圾，将医疗垃圾放入专用大桶内，每天上午由专车收集转运，交接过程中认真做好记录。
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处理：医疗垃圾由本市指定的医疗垃圾处置单位集中处理。各种病原体的培养基、标本和菌种、毒种保存液等高危废物，在产生地点进行压力蒸汽灭菌或其它消毒方法消毒，然后按感染性废物处理。隔离的传染病人或疑似传染病人产生的具有传染性排泄物，按照国家规定严格消毒，达到国家规定排放标准后方可进入污水处理系统；隔离的传染病人或疑似病人产生的医疗废物使用双层包装物并及时密封后按感染性废物处理。病理性废物中的小件废物可按感染性废物处理，较大或大件的病理性废物应送至殡仪馆焚烧。损伤性废物应立即放入防刺、防渗漏的硬质容器中，后放入有明显标识的医用垃圾袋中，由专人定时收集于医院医疗垃圾暂存点，后由本市指定医疗垃圾处置单位集中处理。药物性废物应由药房设专人管理，存入不合格药品区，及时上报药品管理部门，并按药品监督管理部门的意见处理，处理过程应有详细记录。化学性废物中的废弃化学试剂一般用专用贮存桶贮存到一定量后交由本市指定的专门机构处理。含有水银的体温计、血压计报废时，也应交由专门部门，集中处理。
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监管：医院会定期对医疗垃圾的处理情况进行检查，确保所有医疗垃圾都能得到妥善处理。
以上就是医院处理医疗垃圾的基本流程。需要注意的是，不同的医疗垃圾有不同的处理方法，必须严格按照相关规定进行操作。