根据相关法律法规和社保政策，单位和个人在社保缴纳中的责任及扣款方式如下：

一、社保缴纳责任划分

1. 单位责任

   单位需承担社保单位部分的缴纳义务，包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险（个人不缴费）。

2. 个人责任

   个人需承担社保个人部分的缴纳义务，如养老保险8%、医疗保险2%、失业保险0.2%等。

二、扣款方式与合法性

1. 正常扣款流程

   • 单位每月从员工工资中代扣个人应缴社保金额，属于 预扣预缴 行为，符合《工资支付暂行规定》和《劳动法》。

   • 单位需将个人部分和单位部分分别申报并缴纳，不存在从工资中同时扣除两者的情况。

2. 违规操作判定

   若单位将 单位部分 与个人部分合并从工资中扣除，则属于 违法行为 ，可能涉及以下问题：

   • 工资发放不实 ：单位部分应由单位直接缴纳，而非从工资中扣除。

   • 税务风险 ：可能影响个税计算，导致少缴税款。

三、处理建议

1. 核对工资单

   员工应核对工资单，确认单位部分与个人部分的划分是否正确，若发现异常应及时与单位人事部门沟通。

2. 收集证据维权

   若单位存在多扣、乱扣情况，可收集工资条、社保缴纳记录等证据，通过以下途径维权：

   • 协商解决 ：与单位协商补缴或调整工资；

   • 劳动仲裁 ：向当地劳动仲裁机构申请仲裁；

   • 法律诉讼 ：必要时通过诉讼维护权益。

3. 税务申诉

   若涉及税务问题，可向税务机关举报，要求核查单位社保缴纳及工资发放情况。

四、注意事项

• 地区政策差异 ：社保缴费比例可能因地区不同存在差异，需以当地最新政策为准；

• 申报义务 ：单位需按月向社保局申报并缴纳费用，避免因漏缴引发纠纷。

综上，单位和个人社保应分别履行缴纳义务，合并扣款行为不合法且可能引发多重风险，建议通过正规渠道核实并处理相关问题。