阿拉善盟治疗先天性无虹膜比较好的医院是阿拉善盟中心医院。

原因如下：

1. 医院等级和综合实力：阿拉善盟中心医院是一所集医疗、教学、科研、120急救、传染病防治和精神卫生为一体的盟市三级综合医院，具备较强的综合实力和医疗水平。
2. 眼科专业水平：阿拉善盟中心医院眼科拥有多位主任医师和副主任医师，他们在眼科复杂问题如白内障、青光眼、视网膜脱落等疾病的诊断和治疗方面具有丰富的经验。
3. 专家团队：医院拥有一支专业的眼科专家团队，包括张慧明主任医师、杨帆主任医师和田晓燕副主任医师等，他们在眼科疾病的诊断和治疗方面具有很高的专业水平。
4. 治疗方法：对于先天性无虹膜的治疗，阿拉善盟中心医院可以提供多种治疗方法，包括基因治疗、睫状体光凝术、晶状体后囊切开术、人工晶状体植入术和屈光矫正手术等。
5. 患者评价：根据患者的真实就诊评价，阿拉善盟中心医院在治疗无虹膜方面得到了较高的认可和推荐。

其他可考虑的医院：

1. 阿拉善盟蒙医综合医院：该医院的五官科在蒙西医结合治疗眼科疾病方面具有丰富的临床经验，包括角膜炎、结膜炎、白内障、青光眼等。
2. 阿拉善盟第二人民医院：作为阿拉善盟的一家重要医院，它可能也提供眼科服务，包括对先天性无虹膜的治疗。
3. 阿拉善盟妇幼保健院：该医院可能更侧重于儿童眼科疾病，包括先天性无虹膜的治疗。

阿拉善盟中心医院是该地区治疗先天性无虹膜比较好的医院，拥有专业的眼科团队和多种治疗方法。患者可以根据自己的具体情况选择合适的医院和医生进行治疗。建议患者在治疗过程中定期接受眼科专业人员的随访监测，以便及时发现并处理可能出现的问题。