医保卡有余额但在药店刷不了，可能的原因有以下几种：

1. 医保卡未激活 ：

• 用户可以自行前往开户银行或者医保中心激活，也可以拨打社保热线进行激活。

2. 医保卡跨地区使用 ：

• 部分地区的医保卡是无法跨地区使用的。

3. 医保卡过期 ：

• 假如医保卡超过了使用期限，需要重新办理。

4. 所购买的自费药或者物品不在社保报销范围内 ：

• 需要确认所购买的药品或物品是否在社保报销范围内。

5. 医保中心还没有划账 ：

• 医保卡个人账户的钱每月会定时进行划账，如果钱还没有到账，那么自然无法刷出来。

6. 药店系统数据更新不及时 ：

• 有时候药店系统的数据更新不及时，导致医保卡的余额信息无法及时同步。

7. 医保卡故障或磁条磨损 ：

• 医保卡故障或磁条磨损也会导致无法使用，需要重新办理医保卡。

8. 医保基金不足 ：

• 如果医保余额不足，建议用户核实账户余额，然后制定合理的支付方式进行支付。

9. 购买的药品不在医保目录内 ：

• 医保目录中的药品分为甲类和乙类药品，甲类药品可以全额支付，乙类药品需要自付一定比例后，剩余部分由医保基金支付。如果购买的是非医保目录内的药品，医保卡是无法使用的。

10. 医保卡被挂失冻结 ：

• 当医保卡丢失或被盗时，持卡人应及时向发卡机构报失，报失后医保卡将被冻结，直至补办新卡后才能恢复使用。

11. 非定点零售药店 ：

• 医保卡能在药店用，但不是所有药店都可以。有些药店不是定点零售药店，也没办法用医保卡。

12. 医保政策变动 ：

• 医保政策是动态调整的，可能因为最新政策变动而导致医保卡无法使用。

根据以上原因，建议您首先确认医保卡是否已激活，然后检查所购买的药品是否在医保报销范围内，以及医保中心是否已划账。如果以上问题都排除了，建议您咨询当地医保机构或药店，了解具体原因并寻求解决方案。