甘肃合作医疗的缴费流程主要有以下几种方式：
- 通过手机微信缴费 ：
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打开手机微信APP，点击右下角“我”→支付→生活缴费→社保医保→选择XX省/市城乡居民医疗保险→正确输入参保人的身份证号码、姓名→点击确认缴费编号→点击下一步→立即缴费。
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或者在微信中搜索“甘肃省医疗保障局”小程序，通过授权登录或账号登录后，选择“城乡居民基本医疗保险参保缴费”入口，按提示完成缴费。
- 通过支付宝缴费 ：
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打开支付宝APP，点击左下角“城市服务”→选择需要处在的城市→在办事大厅栏中选择“医保”→选择“居民医保缴费”进入页面，按提示操作完成缴费。
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或者在支付宝首页点击市民中心，选择社保页面缴费，输入身份证号姓名，选择城乡居民医疗保险进行查询，选择城乡居民基本医疗保险费，点击缴费完成付款。
- 通过当地人社手机APP缴费 ：
- 下载安装当地人社局官方APP，登录个人账号，点击“城乡居民医保缴费”选项，按提示操作完成缴费。
- 通过银行APP缴费 ：
- 打开银行APP软件，登录本人账号，点击菜单栏“生活”→“社保”，然后选择XX选项，点击确定，输入需要缴费人的身份证号、输入缴费年份，按提示操作完成缴费。
- 现金缴费 ：
- 可以直接到农村的相关代收部门进行代缴。
建议选择一种方便快捷的方式进行缴费，如通过手机微信或支付宝，这样可以随时随地完成缴费操作。同时，注意每年的缴费时间，确保按时缴费，以免影响当年度的报销。