深圳一档和二档社保的主要区别体现在以下几个方面：
- 缴费标准 ：
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养老保险 ：一档和二档的缴费比例相同，单位缴纳比例为14%（深户单位为15%），个人缴纳比例为8%。但缴费基数不同会导致缴费金额有差异，缴费基数是根据职工工资等因素确定的。
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医疗保险 ：一档以职工月工资总额为缴费基数，缴费比例为8.2%（非企业单位为7.2%），其中单位缴纳6.2%（非企业单位为5.2%），个人缴纳2%。二档的缴费基数为深圳市上年度在岗职工月平均工资，缴费比例为0.8%（含生育保险），单位缴纳0.6%，个人缴纳0.2%。
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失业保险 ：单位和个人的缴费比例都是0.7%，各档之间没有区别。
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工伤保险 ：根据行业类别确定缴费比例，各档之间没有区别，单位缴费比例在0.14% - 1.14%之间。
- 医疗待遇 ：
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就医原则 ：一档参保人可以在深圳市内任一定点医疗机构就医，不受限制。二档参保人需要先在绑定的社康中心就医，经社康中心转诊后，可以到绑定的上级医院或其他指定医院就医。
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门诊待遇 ：一档的个人账户用于支付门诊医疗费用，在医保目录内的费用，个人账户余额充足的情况下可以直接支付，而且报销比例较高。二档在绑定社康中心看门诊，可以享受医保统筹基金报销，甲类药品报销比例为80%，乙类药品报销比例为60%。
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住院待遇 ：一档的住院报销比例根据医院级别等因素有所不同，在一级医院的报销比例可以达到90%。二档的住院待遇与一档相同，包括住院报销比例和起付线以及最高支付额度。
- 个人账户 ：
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一档 ：设有医保个人账户，可用于支付本人及其配偶、父母、子女、近亲属的符合国家、广东省及本市规定的费用。个人账户的划入标准为缴费基数的2%。
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二档 ：没有个人账户，超出医保统筹基金和地方补充医保基金的部分要自付。
- 其他 ：
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门诊额度 ：一档的门诊额度为10478.4元，二档为2619.6元，这个差距较大，超过额度的是报销不了的。而且二档需要去指定社康医院才能用门诊，一档没有限制可以直接去。
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自费缴纳 ：非深户一档比非深户二档每月多交336.65元，这些多交的费用主要在于医疗方面。
综上所述，深圳一档和二档社保在缴费标准、医疗待遇、个人账户等方面存在明显差异。一档的缴费基数和比例较高，但医疗待遇也更好，包括更高的门诊报销比例和更广泛的就医选择。二档的缴费基数和比例较低，医疗待遇相对较差，但就医选择相对受限。建议根据个人需求和实际情况选择合适的社保档次。