重庆职工医保一档和二档的主要区别体现在以下几个方面：
- 个人账户 ：
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一档 ：没有个人账户，所有医保待遇都依赖于单位职工医保。
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二档 ：建立个人账户，每个月会有资金划入，可用于门诊和购药。
- 特殊疾病门诊 ：
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一档 ：目前能享受4类特殊疾病医保报销，包括恶性肿瘤放疗、化疗、镇痛治疗，肾功能衰竭病人的透析治疗，肾移植后抗排异治疗，血友病。
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二档 ：目前能享受21类特殊疾病医保报销，病种及待遇与单位参保人员一致。
- 住院报销比例 ：
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一档 ：
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三级医院：在职职工85%，退休职工95%。
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二级医院：在职职工87%，退休职工95%。
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一级医院：在职职工90%，退休职工95%。
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基本医保报销限额：4.7万元/人·年，超过部分由职工大额互助医疗保险基金按照100%比例报销，年报销限额为50万元/人·年。
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二档 ：
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三级医院：在职职工85%，退休职工95%。
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二级医院：在职职工87%，退休职工95%。
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一级医院：在职职工90%，退休职工95%。
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基本医保报销限额：4.7万元/人·年，超过部分由职工大额互助医疗保险基金按照100%比例报销，年报销限额为50万元/人·年。
- 普通门诊 ：
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一档 ：普通门诊年报销限额为300元。
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二档 ：普通门诊年报销限额为500元。
- 缴费标准 ：
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一档 ：每人每年320元。
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二档 ：每人每年695元。
二档的待遇相对更全面一些，有个人账户，并且能享受更多的特殊疾病报销。一档则没有个人账户，但住院报销比例和限额与二档一致。建议根据个人需求和缴费能力选择合适的医保档次。