重庆医保新农合一档和二档的区别主要体现在以下几个方面：
- 缴费标准 ：
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一档：320元/人·年。
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二档：695元/人·年。
- 门诊报销 ：
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一档：
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一级医疗机构：60%
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二级医疗机构：40%
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三级医疗机构：不报销
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年报销限额：300元。
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二档：
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一级医疗机构：60%
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二级医疗机构：40%
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三级医疗机构：不报销
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年报销限额：500元。
- 住院报销 ：
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一档：
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三级医疗机构：50%
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二级医疗机构：70%
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一级医疗机构：80%
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报销限额：8万元/人·年。
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二档：
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三级医疗机构：55%
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二级医疗机构：75%
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一级医疗机构：85%
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报销限额：12万元/人·年。
- 缴费比例 ：
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一档：单位缴纳6%，个人缴纳2%，合计8%。
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二档：单位和个人均缴纳0.5%，合计1%。
- 就医原则 ：
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一档：可在市内任一定点医疗机构就医。
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二档：门诊在选定社卫中心就医，经结算医院同意，可在与选定社卫中心同属于一家医疗集团网格内定点医疗机构之间转诊。
- 其他待遇 ：
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二档参保人员有个人账户，每月划入社保卡的钱可用于看病买药。
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一档参保人员没有个人账户。
总的来说，一档的缴费金额较高，但报销比例和限额也相应较高，适合经济条件较好的家庭选择；二档的缴费金额较低，报销比例和限额也略低一些，适合经济条件相对较差的家庭选择。建议根据自身的经济状况和健康状况来选择合适的医保档次。