在西藏林芝地区，治疗真菌性角膜炎较好的医院包括以下几家：
西藏自治区人民医院
- 医院简介：设有职能处室13个，临床、医技科室29个，拥有西藏急救中心、西藏自治区妇幼保健院、西藏高原医学研究所等设施，是自治区干部保健基地、全科医生临床培养基地、西藏大学非直属附属医院。
- 擅长领域：白内障、玻璃体混浊、飞蚊症、干眼症、近视、结膜炎、泪囊炎、角膜炎、角膜溃疡、老年性黄斑变性、麦粒肿、葡萄膜炎、青光眼、散光、视神经炎、远视、睑缘炎、睑裂斑等疾病的治疗。
中国人民解放军西藏军区总医院
医院简介：前身是川东军区直属医院，1949年11月组建于重庆市长寿县，1955年更名为陆军第49医院，1962年被命名为西藏军区总医院。
那曲地区人民医院
医院简介：位于西藏自治省那曲地区那曲镇色尼路260号。
林芝地区人民医院
医院简介：位于藏东南政治、经济、文化、交通中心八一镇，始建于1966年6月，现占地面积70107.37平方米。
拉萨市人民医院
医院简介：1959年4月成立，前身名为拉萨市军事管制委员会门诊部，1962更名为拉萨市人民医院。
请注意，以上排名仅供参考，具体选择哪家医院还需根据患者的具体病情、医院的诊疗设备、医生的专业水平以及患者的经济条件等因素综合考虑。建议患者在选择医院前，可以通过网络、咨询台等途径了解各家医院的详细信息，以便做出更合适的选择。