以下是北京最好的呼吸科医保定点医院：

1. 中日友好医院

• 全国排名 ：全国医院排名第29名，华北区域排名第10名。

• 呼吸与危重症医学科排名 ：全国排名第2。

• 特点 ：国家呼吸医学中心、国家呼吸系统疾病临床医学研究中心，诊疗范围全面，涵盖呼吸衰竭与内科危重症、慢阻肺、哮喘与慢性咳嗽、呼吸系统感染、肺栓塞、肺动脉高压、肺心病、间质性肺疾病、烟草病学与烟草依赖治疗、中医肺病、肺移植、呼吸康复等多个领域。

2. 北京协和医院

• 全国排名 ：全国医院排名第1名，华北区域排名第1名。

• 呼吸与危重症医学科排名 ：全国排名第4名。

• 特点 ：历史悠久、底蕴深厚，细分为11个专业分组，包括慢性阻塞性肺疾病组、睡眠呼吸障碍组、间质性肺病组、肺癌中心、肺栓塞与肺血管疾病组、哮喘组、危重症医学组、感染组、介入组、呼吸治疗组和控烟组。

3. 中国人民解放军总医院（301医院）

• 全国排名 ：全国医院排名第3名，华北区域排名第2名。

• 呼吸与危重症医学科排名 ：全国排名第7名。

• 特点 ：国家重点学科、全军呼吸病研究所、全军和北京市重点实验室，是国内规模较大、亚专科设置较全、内外介入一体化的胸科医疗单位之一。

4. 首都医科大学附属北京朝阳医院

• 全国排名 ：全国医院排名第77名，华北区域排名第16名。

• 呼吸科特点 ：擅长肺部感染性疾病、间质性肺疾病的诊治，积累了丰富经验。

5. 北京大学第一医院

• 全国排名 ：未提供具体全国排名，但为北京市医保定点医院。

• 呼吸科特点 ：在慢性阻塞性肺疾病、哮喘等方面有较高的诊治水平。

这些医院在呼吸科领域具有很高的声誉和专业水平，能够为患者提供全面、精准的诊疗服务。建议根据具体病情和需求选择合适的医院进行就诊。