在西藏拉萨，有多家医院在治疗非结核分枝杆菌性角膜炎方面具有良好的口碑和专业能力。以下是一些推荐的医院：

西藏自治区人民医院

• 医院等级：三甲
• 特色：西藏自治区人民医院是西藏最大的综合性医院，其眼科已发展成为西藏自治区内集医、教、研为一体的最大眼科科室。该科室设备先进，人员充足，开展的新项目多，在西藏的防盲治盲工作中贡献突出，主要诊治各种眼科常见病与疑难病，如结膜炎、角膜炎等。
• 地址：西藏自治区拉萨市林廓北路18号。
• 联系方式：0891-6371322(办公室)。

拉萨市人民医院

• 医院等级：三甲
• 特色：拉萨市人民医院是一家建筑面积约3840平方米，拥有床位200多张，职工320名的三甲综合医院。其眼科可提供全面的眼科服务，涵盖常见眼病的治疗以及复杂的眼科手术。
• 地址：拉萨市北京中路1号。
• 联系方式：0891-6323338(医务处)。

西藏军区总医院

• 医院等级：三级甲等
• 特色：西藏军区总医院前身是川东军区直属医院，纪律严明，医疗质量高，服务态度好。医院拥有完善的诊疗设施和充足的医疗人员储备，在眼科疾病的诊疗方面也有较高的水平。
• 地址：西藏自治区拉萨市娘热路。
• 联系方式：0891-6858120。

请注意，以上信息仅供参考，具体选择哪家医院还需根据患者的具体病情、医院的专科特长、地理位置、交通便利性等因素综合考虑。建议患者在就诊前进行详细的咨询和预约，以便获得最适合的治疗方案。