农村合作医疗转市医保的流程如下：

1. 提出申请 ：

• 参保单位或本人到转出地乡镇（区县）农保机构提出转至城保或镇保的申请，提交相关材料，并填写《个人帐户变更申报表》。

2. 信息录入 ：

• 乡镇（区县）农保机构操作人员录入转至城保或镇保的相关申报信息。

3. 基金判断 ：

• 系统自动判断该人员在本乡镇是否有基金。如果存在其他乡镇的基金，系统会提示该人员需到其他乡镇办理转移手续。

4. 受理通知 ：

• 打印关系转移受理通知单，交当事人。

5. 资料上传 ：

• 乡镇农保机构在受理后，将相关资料及表式上传至区县农保中心。

6. 办理注销 ：

• 在原参保地办理医保关系注销手续，并携带相关材料到转入地的社保中心提出医保关系转移申请。

7. 提交材料 ：

• 携带好转出地经办机构出具的《参保（合）凭证》、原参保地医保缴费凭证和《xx省医疗保险关系转移申请表》到市社保基金结算中心办理医保关系和个人账户转移手续。

8. 审核与接续 ：

• 转入地的社保经办机构审核通过后，向原参保地社保经办机构发送《基本养老保险、医疗保险关系转移接续联系函》。原参保地社保经办机构收到联系函后转移基本养老保险和医疗保险关系，按规定转移基金，并向转入地社保经办部门发送《基本养老保险、医疗保险关系转移接续信息表》。

9. 待遇享受 ：

• 待基金到账后，转入地的社保经办机构凭信息表接续养老保险、医疗保险关系及个人帐户，并将办结情况通知用人单位或本人。

建议：

• 在办理医保转移前，建议先咨询当地社保部门或通过官方渠道了解详细流程和所需材料，以确保流程顺利进行。

• 如果有接收单位，可以由接收单位办理相关手续，这样可以简化个人办理流程。