全国最好的内分泌科医院主要排名如下：

上海交通大学医学院附属瑞金医院

• 优势：瑞金医院的内分泌科在糖尿病、甲状腺疾病等内分泌代谢病的诊疗方面处于国内领先水平，是国家重点学科，拥有先进的诊疗设备和专业的医疗团队。

• 排名：2021复旦版医院专科榜中内分泌科排名第1名。

中国医学科学院北京协和医院

• 优势：北京协和医院的内分泌科是国家重点学科，科室始终保持全方位的研究方向，是全国内分泌学科中最完整、最全面的科室。

• 排名：2021复旦版医院专科榜中内分泌科排名第2名。

中国人民解放军总医院

• 优势：解放军总医院的内分泌科在内分泌疾病的诊疗上具有强大的实力，科室获军队科技进步二等奖3项，省部级科技进步奖4项。

• 排名：2021复旦版医院专科榜中内分泌科排名第3名。

中南大学湘雅二医院

• 优势：湘雅二医院的内分泌科在糖尿病、甲状腺疾病等内分泌疾病的诊疗方面具有丰富的经验，是国家重点科室。

• 排名：2021复旦版医院专科榜中内分泌科排名第4名。

中国医科大学附属第一医院

• 优势：中国医科大学附属第一医院的内分泌科是国家重点科室，科室在内分泌疾病的诊疗方面具有较高的水平。

• 排名：2021复旦版医院专科榜中内分泌科排名第5名。

以上医院在内分泌科领域均具有较高的声誉和专业的医疗水平，患者可以根据自己的实际情况和需求选择合适的医院进行就诊。