新农合门诊自费后，可以通过以下途径进行报销：

1. 乡、村级定点医疗机构 ：

• 参保农民在乡、村级定点医疗机构就诊时，可以直接减免门诊补偿费用。门诊医疗总费用减去门诊补偿费用剩余部分由参保农民现金结算。

2. 省、市、区级定点医疗机构 ：

• 对于因患慢性病和重大疾病在省、市、区定点医疗机构门诊就诊的参保农民，所产生的医疗费用需要先由参保农民现金结算。经各乡镇合管办初审后上报至区合管办审核，审核通过后由户籍所在乡镇卫生院录入新农村合作医疗机构垫付资金，最后经区合管办审批后直接划拨到定点医疗机构新农合资金专户。

3. 市内定点医疗机构 ：

• 参保患者在区内乡镇级普通门诊定点医疗机构可以直接刷卡报销，在区内及区外市内定点医疗机构住院，出院结帐时也可直接刷卡报销。

4. 市外定点医疗机构 ：

• 在市外二级及二级以上公立医疗机构住院治疗的参保患者，应在出院后三个月内，由参保人或其家属带医药费用原始发票（复印件无效）、住院医药费用汇总明细清单、出院小结及门诊病历、患者身份证、医疗卡、户口簿、经办人身份证到区行政服务中心新农合窗口报销医药费用。

5. 特殊病种门诊 ：

• 对于高血压、糖尿病等慢性病以及恶性肿瘤门诊放化疗、尿毒症透析等特殊疾病门诊治疗的患者，需持病历、化验报告等相关资料及《新农合特殊病种门诊治疗审批表》，向新农合业务管理中心提出申请，审核通过后进行报销。

建议

• 及时办理转诊备案 ：如果需要在市外定点医疗机构就诊，务必提前办理转诊备案手续，以免影响报销。

• 收集齐全报销材料 ：在报销时，需携带完整的医疗费用票据和报销材料，确保材料的真实性和合规性。

• 了解报销比例和限额 ：不同级别的定点医疗机构和不同的医疗费用项目有不同的报销比例和限额，建议提前了解清楚，以便更好地规划医疗费用。