云南保山治疗流行性出血性结膜炎的医院中，保山市人民医院和保山市第二人民医院是较为突出的选择。以下是推荐理由及分点说明：
1. 保山市人民医院
- 综合实力强：作为三级甲等综合医院，医院科室齐全，医疗设备先进，拥有全市领先的诊疗水平。
- 眼科专业突出：医院眼科是云南省保山市眼科质量控制分中心，并设有“胡竹林专家团队工作站”，专注于眼科疑难杂症的诊治。
- 医疗设备先进：配备超广角眼底成像系统、光学相干断层扫描血管成像（OCTA）等先进设备，为结膜炎的诊断和治疗提供保障。
- 医生团队经验丰富：眼科团队拥有主任医师、副主任医师、硕士研究生等专业人才，具备高水平的诊疗能力。
2. 保山市第二人民医院
- 专家资源丰富：定期邀请云南省红会医院儿童眼科专家李亚娣博士坐诊，擅长结膜炎等眼部疾病的诊治。
- 服务便捷：医院提供详细的预约挂号流程，患者可通过电话或现场预约，减少等待时间。
- 诊疗范围广泛：除结膜炎外，医院还开展干眼治疗、视功能异常诊治等项目，满足多样化需求。
3. 选择建议
- 如果您希望获得权威性保障和全面的医疗服务，建议选择保山市人民医院。
- 如果您更倾向于专家资源和便捷服务，可优先考虑保山市第二人民医院。
无论选择哪家医院，建议提前预约挂号，并根据医生建议进行治疗。保持良好的眼部卫生习惯，有助于疾病的快速恢复。