南方医科大学和汕头大学都是中国知名的医学院校，各有其优势。以下是它们的一些比较：
- 历史背景和排名 ：
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南方医科大学是原中国人民解放军第一军医大学，1979年被确定为全国重点大学，2004年被批准为中国8所试办八年制医学教育的高等院校之一。南方医科大学的口腔医学在全国排名靠前，临床医学和外科学（包括普外科、整形外科等）也是其强项。
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汕头大学医学院由李嘉诚先生资助创办，是广东省211工程的一部分。虽然具体排名信息较少，但汕头大学医学院在临床医学和病理学方面具有优势，特别是在粤东地区。
- 学科建设和科研实力 ：
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南方医科大学拥有2个国家级重点学科、2个国家中医药管理局重点学科、1个国家级临床药理基地和1个国家级中医药理基地等，科研实力雄厚。
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汕头大学医学院虽然科研实力相对较弱，但拥有国家级精品课程和省级精品课程，荣获国家教学成果二等奖，并在临床医学和病理学方面表现突出。
- 附属医院和地理位置 ：
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南方医科大学拥有南方医院和珠江医院等多所知名附属医院，特别是在广州，这些医院在医疗技术、科研创新和人才培养方面具有很高的声誉。
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汕头大学医学院的附属医院相对较少，主要集中在汕头地区，虽然在本地有较高的影响力，但在广州等大城市的附属医院数量和质量上不如南方医科大学。
- 录取分数线 ：
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南方医科大学的录取分数线较高，例如2016年湖北的录取分数线至少要过一本线100分以上。
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汕头大学医学院的录取分数线相对较低，2014年在广东的最低分为592分。
- 国际化办学 ：
- 汕头大学医学院在国际化办学方面具有优势，2007年开设医学教育全英班，实行全额奖学金，采用全英文专业授课，并引进美国执业医师考试。
总结 ：
南方医科大学在整体实力、学科建设、附属医院和地理位置等方面具有明显优势，特别是在广州的影响力较大。汕头大学医学院虽然在某些专业领域（如临床医学和病理学）表现突出，但在整体实力和附属医院方面不如南方医科大学。因此，如果毕业后计划在珠三角地区发展，南方医科大学可能是更好的选择；如果希望在粤东地区发展，汕头大学医学院也是一个不错的选择。