合作医疗在医院拿药报销的流程和政策可能会因地区和具体的合作医疗制度而有所不同，但通常的流程如下：
报销范围
基本医疗保险药品目录：只有在基本医疗保险药品目录内的药品才能报销。
门诊和住院用药：门诊和住院期间使用的药品，如果符合目录规定，可以报销。
报销流程
就医时出示证件：在定点医疗机构就医时，需携带并出示合作医疗证或医保卡，以便医疗机构确认参保身份。
医院直接结算：在市内定点医疗机构就诊时，可以直接在医院的结算窗口刷卡报销，医院会按照合作医疗的报销政策，计算出可报销的金额，并直接在患者的总费用中扣除。
提交申请材料：如果是在市外就医或需要手动报销，患者需要准备医疗费用原始发票、住院医药费用汇总明细清单、出院小结及门诊病历、患者身份证、医疗卡、户口簿等材料。
审核与核算：将准备好的材料提交给所在地区的行政服务中心新农合窗口或乡镇卫生院合作医疗窗口，窗口工作人员会对提交的材料进行审核，确保材料真实有效，审核通过后，工作人员会核算补偿范围内的医药费用和补偿金额。
费用兑付：核算完成后，费用将直接打到患者指定的银行账户中，或由窗口工作人员直接支付给患者。
报销比例
普通门诊：在一级定点医疗机构（含村卫生室）发生的新规范围内门诊医疗费用按80%比例报销，在二级及以上定点医疗机构发生的新规范围内门诊医疗费用按60%比例报销。
慢性病门诊：门诊慢特病报销时不设起付线，在相应病种年度报销限额内，按新规范围内费用的70%（乙类项目先由个人自付10%后计算）进行报销。
住院用药：住院医疗费用的报销比例因医疗机构级别而异，一级医疗机构报销比例可达90%，二级医疗机构报销比例可达80%，三级医疗机构报销比例可达60%。
注意事项
定点医疗机构：只能在指定的定点医疗机构就诊才能享受报销政策。
药品和诊疗项目限制：部分药品和诊疗项目可能不在报销范围之内。
报销时间限制：不同地区可能有不同的规定，一般要求在一定时间内完成报销申请，逾期可能会影响报销。
建议在就医前咨询当地的医保部门或所在医疗机构的合作医疗窗口，了解具体的报销政策和流程。