农村合作医疗跨市可以报销，但需要满足一定条件和流程：
备案
异地长期居住人员：需办理登记备案，备案长期有效。
临时外出就医人员：包括异地转诊人员，因工作、旅游等原因异地急诊抢救人员以及其他临时外出就医人员，备案有效期原则上不少于6个月。
就医
选择定点医疗机构：参保人员应在就医地的异地联网定点医药机构就医。
结算
直接结算：参保人员在就医地的异地联网定点医药机构就医时，主动表明参保身份，出示医保电子凭证或社会保障卡等有效凭证，即可享受住院及部分门诊慢特病的跨市直接结算服务。
手工报销：因结算网络系统、就诊凭证等故障导致无法直接结算的，相关医疗费用可回参保地手工报销。
报销比例
不同地区：不同地区的报销政策和比例可能有所不同。例如，在广东省内跨市就医，住院起付线和报销比例按参保市规定执行。
不同等级医院：报销比例通常因医院等级而异。例如，乡镇卫生院就医，起付线为100元，报销比例为90%；县级定点医院就医，起付线为200元，报销比例为82%；市级定点医院就医，起付线为500元，报销比例为65%。
注意事项
资料准备：报销时需提供相关资料，如发票、费用清单、诊断证明、身份证、社保卡等。
时间限制：异地就医医疗费用原则上采用联网方式进行直接结算。对于无法联网结算的医疗费用，原则上在费用发生后的次年3月31日前送至参保地基本医保经办机构进行手工报账。
农村合作医疗跨市可以报销，但需提前备案，并选择定点医疗机构就医，以确保享受相应的医疗保障待遇。