医院花费5万农村医保报销的金额取决于多个因素，包括就医的医疗机构级别、具体的医保报销政策以及是否符合大病保险的条件等。以下是不同情况下大致的报销金额：

一级医疗机构住院报销

• 报销比例：政策范围内报销比例可达90%。

• 计算方式：报销金额 = 总费用 × 报销比例。

• 示例：如果在乡镇卫生院住院，医疗费用为5万元，报销金额为50000 × 90% = 45000元，个人需支付5000元。

二级医疗机构住院报销

• 报销比例：政策范围内报销比例可达80%。

• 计算方式：报销金额 = 总费用 × 报销比例。

• 示例：如果在县级医院住院，医疗费用为5万元，报销金额为50000 × 80% = 40000元，个人需支付10000元。

三级医疗机构住院报销

• 报销比例：政策范围内报销比例可达60%。

• 计算方式：报销金额 = 总费用 × 报销比例。

• 示例：如果在市级医院住院，医疗费用为5万元，报销金额为50000 × 60% = 30000元，个人需支付20000元。

大病保险报销

• 起付线及报销比例：大病保险起付线以上的费用按60%支付，最高限额可达25万元。

• 计算方式：如果个人负担的医疗费用超过起付线（假设为1万元），则报销金额 = （总费用 - 起付线）× 报销比例。

• 示例：如果个人负担的医疗费用为5万元，超过起付线4万元，报销金额为40000 × 60% = 24000元。

具体的报销金额还需根据当地的医保政策和医院的级别来确定。建议咨询当地的医保部门或医院的医保科，以获取更准确的信息。