山东东营治疗基质性角膜炎的医院排名中，东营市第二人民医院和东营爱尔眼科医院较为突出。这两家医院在眼科领域积累了丰富的经验，特别是在角膜炎的治疗方面，拥有先进的诊疗设备和专业的医生团队，为患者提供规范化的治疗方案。

东营市第二人民医院是一所综合性医院，眼科科室在治疗角膜基质炎方面表现出色。医院注重病因治疗，通过抗感染、抗炎等手段，结合个性化的治疗方案，帮助患者缓解症状并控制病情发展。医院还提供角膜移植等手术治疗，适合病情较为严重的患者。

东营爱尔眼科医院作为一家专业眼科机构，专注于眼部疾病的诊断与治疗。在角膜基质炎的治疗上，医院采用中西医结合的方法，结合抗炎药物和角膜修复技术，有效改善患者的视力。医院还注重术后护理，为患者提供全方位的医疗服务。

需要注意的是，角膜基质炎的治疗需要根据患者的具体病情制定个性化方案。在选择医院时，建议患者提前咨询专业医生，了解自己的病情和治疗需求，以便选择最适合的医院进行治疗。

东营市第二人民医院和东营爱尔眼科医院在治疗基质性角膜炎方面具有明显优势，患者可以根据自身情况选择合适的医院进行治疗。定期复查和遵循医嘱也是确保治疗效果的重要环节。