北医三院北方院区和本部的主要区别如下：
- 地理位置 ：
- 北方院区位于北京市海淀区，而本部位于北京市东城区。这种差异可能导致患者在就诊时耗费更多的时间和精力，尤其是从海淀区到东城区需要提前规划路线并在路上花费更多时间。
- 设施与环境 ：
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北方院区拥有更先进的医疗设备和环境，注重患者的舒适度和体验，以人性化为主导。
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本部则以传统的医疗设施为主，可能更注重医疗服务的专业性和传统性。
- 科室与专家 ：
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北方院区已经开设了多个科室，并由本部专家出诊，包括心血管内科、呼吸与危重症医学科、内分泌科、肾内科、消化科、普通外科、骨科、泌尿外科、妇产科、眼科、耳鼻喉科等。
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本部也设有这些科室，并且有高年资专家坐诊。
- 管理 ：
- 北方院区和本部实行同质化管理，这意味着两个院区的医疗服务质量、管理模式和收费标准等方面基本相同。
- 服务人群 ：
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北方院区原为兵器工业北京北方医院，服务的对象主要为车道沟10号院内的职工及家属。后经过联合办医和维修改造，现在主要承担三院的体检和住院部分工作。
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本部则主要服务更广泛的患者群体。
- 交通便利性 ：
- 北方院区距离本部约11公里，打车大约需要30元左右的车费，相对本部可能更方便一些。
- 挂号情况 ：
- 有观点认为北方院区挂号相对容易一些，不需要像本部那样长时间排队取号。
综上所述，北医三院北方院区和本部在地理位置、设施与环境、科室与专家、管理、服务人群、交通便利性和挂号情况等方面存在一定的差异。患者可以根据自己的实际情况和需求选择合适的院区就诊。