不会扣
在江苏南通地区，员工因健康原因请病假期间，高温补贴通常不会被扣除，因为该项补贴本质是针对高温天气工作的劳动补偿；但单位在发放时可能根据出勤情况调整支付，员工应核对其合同或当地法规以明确。

一、 高温补贴的基本概念与政策依据

1. 定义与目的：高温补贴是雇主在夏季高温期间为补偿员工在高温环境工作额外负担而支付的津贴，旨在保护健康并预防中暑风险，依据国家《防暑降温措施管理办法》执行。
2. 江苏南通的本地标准：该地区高温补贴发放基于日高温超35℃ 的条件，金额由地方规定，员工可咨询人力资源和社会保障部门了解详情。
3. 常见支付形式：通常按月或季度固定发放，支付对象需满足实际工作期间在岗条件；否则单位可能暂停支付。

二、 病假对高温补贴的具体影响机制

1. 病假的界定：病假指员工因健康问题（如疾病或中暑）需休假的时间；根据劳动法，该期间基本工资按比例支付，但高温补贴并非工资组成。
2. 发放逻辑：由于补贴基于实际工作期间发放，病假期间员工未出勤时，单位可能不支付当周期补贴；但非永久扣除。
3. 单位政策差异：不同企业处理方式不一，如大型国企可能连续支付，而私企则按缺勤调整；员工应参考劳动合同避免权益受损。

三、 健康防护与权益保障建议

1. 防暑健康措施：高温季节员工应加强中暑预防，如补充水分、减少户外暴露；及时请病假以防健康恶化影响补贴连续性。
2. 权益维护途径：如遇单位违规扣除，员工可向江苏南通劳动监察部门申诉或寻求工会帮助；保存工作记录为证据。
3. 长期健康管理：定期体检和接种疫苗可降低病假频率，确保工作稳定性；单位也应提供防暑设施以履行社会责任。

高温天气下维护健康是保障劳动权益的基础在江苏南通员工请病假虽可能与高温补贴的当期支付相关但不会导致扣除现象关键在于主动沟通单位政策和注重个人防护以实现工作与健康的平衡。