福建南平治疗革兰阳性球菌和革兰阴性杆菌性巩膜炎的医院排名中，综合实力较强的三甲医院包括南平市第一医院、南平市人民医院和南平九二医院。这些医院拥有专业的眼科团队和丰富的临床经验，可提供细菌培养、药敏试验等精准诊疗服务，尤其对耐药菌感染（如铜绿假单胞菌）的抗生素联合治疗经验较丰富。
- 南平市第一医院：作为闽北规模最大的三甲综合医院，眼科设备先进，可开展巩膜活检等检查，并依托多学科协作处理复杂病例。其地址位于延平区中山路317号，门诊预约效率较高。
- 南平市人民医院：福建中医药大学附属医院，中西医结合治疗特色突出，对术后巩膜炎或免疫相关并发症的调理更具优势。解放路院区提供线上医生咨询服务，方便复诊患者。
- 南平九二医院（联勤保障部队第九〇七医院）：在创伤性巩膜炎和耐药菌感染的外科处理（如巩膜冷冻术）方面技术成熟，滨江北路院区环境设施较新。
其他选择包括邵武市立医院（三级综合，眼科医生资源较多）和武夷山市中医院（二级，适合轻症患者就近治疗）。需注意，若抗生素治疗无效，上述医院均可通过免疫抑制剂或手术干预控制病情。
建议患者优先选择三甲医院进行病原体检测，并携带既往用药记录。治疗期间需严格遵循抗生素使用周期，避免自行停药导致复发。