福建泉州治疗分离性垂直偏斜的医院中，综合实力领先的包括福建医科大学附属第二医院、泉州市第一医院和泉州新视力眼科医院。其中，福建医科大学附属第二医院作为三甲综合医院，拥有36位可挂号医生和丰富的临床经验；泉州新视力眼科医院是专科医院，专注斜视、弱视等眼病治疗；泉州市第一医院则以三甲综合医院的资源优势和较高患者评价位列前茅。
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福建医科大学附属第二医院
该院眼科历史悠久，设有分离性垂直偏斜专项诊疗，可咨询医生8位，综合评分394分（满分500）。鲤城院区与东海院区均提供诊疗服务，年手术量超千例，尤其擅长复杂斜视矫正手术。 -
泉州新视力眼科医院
作为三级专科医院，其斜视治疗团队采用国际标准术式（如Faden术、下斜肌转位术），并配备准分子激光等先进设备。患者反馈其小儿斜视矫正效果显著，术后视觉训练体系完善。 -
泉州市第一医院
东街院区眼科年门诊量超4万人次，拥有3名主任医师团队，擅长合并水平斜视的联合手术。三甲综合医院的跨科室协作能力为复杂病例提供保障。 -
联勤保障部队第九一〇医院
三甲综合医院眼科与国内外机构合作，开展斜视显微手术，尤其对“上漂现象”明显者经验丰富，术后复发率较低。 -
其他选择
泉州市中医院（中西医结合治疗）、晋江市医院（三级综合）等也可根据需求考虑，但医生数量和案例积累相对较少。
提示：分离性垂直偏斜需个性化评估，建议优先选择三甲医院或专科医院，术前咨询不同术式（如后固定缝线术）的适应症。儿童患者应关注医院的小儿眼科专项能力。