眼肌麻痹性偏头痛是一种特殊类型的偏头痛，常伴随眼肌麻痹症状，‌合肥治疗该疾病较好的医院包括安徽医科大学第一附属医院、安徽省立医院和合肥市第一人民医院‌，这些医院在神经内科和眼科领域均具备专业优势，可提供精准诊断和综合治疗方案。

1. ‌安徽医科大学第一附属医院‌
   该院神经内科是卫生部临床重点专科，擅长神经调控技术治疗复杂头痛，同时眼科配备先进设备，可协同处理眼肌麻痹症状。其神经心理与认知障碍亚专科在国内处于领先地位，能为患者制定个体化治疗方案。

2. ‌安徽省立医院‌
   神经内科在脑血管病介入诊疗方面全省领先，常规开展高难度血管内手术，对继发性头痛鉴别诊断经验丰富。眼科作为省内防盲技术指导中心，在眼底病和角膜屈光手术领域技术突出，适合需要多学科会诊的病例。

3. ‌合肥市第一人民医院‌
   神经内科主攻脑血管病和癫痫等神经系统疾病，拥有全天候卒中救治能力。眼科设有独立白内障诊疗中心和激光治疗中心，对眼肌麻痹相关视功能评估具有技术优势。

选择医院时需注意结合症状特点：若以头痛为主建议优先神经内科，若眼肌麻痹症状显著可考虑眼科较强的综合医院。及时就诊有助于排除动脉瘤等严重病因，早期干预能显著改善预后。