​​胃间质瘤的病理分型主要包括梭形细胞型、上皮样细胞型、梭形细胞 - 上皮样混合型及去分化型四种，其中梭形细胞型最为常见，占50% - 70%。​​

梭形细胞型胃间质瘤主要由形态相对一致的梭形细胞构成，瘤细胞密度、异型性和核分裂象在不同病例中存在差异，部分患者核端可见空泡，瘤细胞多呈束状或交织状排列，少数可见器官样、假菊形团样或栅栏状排列。上皮样细胞型占比20% - 40%，瘤细胞呈上皮样、圆形或多边形，胞质淡染、嗜伊红色或透亮，少数呈印戒细胞样或蜘蛛网状细胞样，多呈弥漫片状、巢状或结节状排列。梭形细胞 - 上皮样混合型较为少见，占比10%，由梭形细胞与上皮样细胞混合而成，两种成分可界限清晰或有移行过渡。去分化型胃间质瘤则是在GIST中出现非GIST高级别去分化成分，如横纹肌肉瘤、血管肉瘤等，可能发生于原发性GIST或靶向治疗后，预后较差。

不同病理亚型对应不同的细胞形态和排列方式，这些特征对临床诊断和预后评估至关重要。梭形细胞型因生长方式较局限，部分病例预后相对较好，而上皮样型中SDH基因突变亚型多呈多结节生长，需警惕复发风险。混合型及去分化型由于肿瘤异质性强，需结合分子检测明确诊断，尤其去分化型可能对传统靶向药物耐药。早期精准分型能为患者制定个性化治疗方案提供关键依据。