西藏林芝社保基数20400元和5000元的区别主要体现在缴费金额和所涵盖的险种及比例方面，具体区别如下：
缴费金额
- 社保缴费基数20400元：
- 个人费用约为：554.208元
- 企业费用约为：1108.416元
- 社保缴费基数5000元：
- 个人养老保险：5000 * 8% = 400元
- 个人医疗保险：5000 * 2% = 100元
- 个人失业保险：5000 * 0.5% = 2.5元
- 企业养老保险：5000 * 16% = 800元
- 企业医疗保险：5000 * 6.5% = 325元
- 企业失业保险：5000 * 0.5% = 2.5元
- 企业工伤保险和生育保险由企业全额承担
涵盖的险种及比例
- 社保缴费基数20400元：
- 养老保险：公司缴费比例为16%，个人缴费比例为8%。
- 医疗保险：公司缴费比例为6.5%（或法规调整后的比例），个人缴费比例为2%。
- 失业保险：公司缴费比例为0.5%，个人缴费比例为0.5%。
- 生育保险：公司缴费比例为0.7%（由公司全额承担）
- 社保缴费基数5000元：
- 养老保险：个人缴费比例为8%，企业缴费比例为16%。
- 医疗保险：个人缴费比例为2%，企业缴费比例为6.5%。
- 失业保险：个人缴费比例为0.5%，企业缴费比例为0.5%。
- 工伤保险和生育保险由企业全额承担。
西藏林芝社保基数20400元和5000元在缴费金额和所涵盖的险种及比例方面均存在显著差异。具体选择哪个缴费基数，应根据个人工资水平、企业负担能力以及个人对未来社保待遇的期望等因素综合考虑。