西藏日喀则社保基数12800元和5000元的核心区别在于缴费金额、福利待遇及长期权益积累。高基数（12800元）意味着更高的个人和企业缴费额，对应养老金、医保报销等社保待遇水平显著提升；低基数（5000元）缴费压力较小，但未来享受的社保待遇相对较低。具体差异体现在以下方面：
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缴费金额差异
以养老保险为例，个人缴费比例为8%：- 基数12800元：个人月缴元，企业缴元；
- 基数5000元：个人月缴元，企业缴元。
高基数下每月多缴624元，但统筹账户和个人账户积累更快。
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养老金待遇差距
养老金计算与缴费基数直接挂钩。高基数缴费者退休时的基础养老金和个人账户养老金均更高。例如，相同缴费年限下，12800元基数者的养老金约为5000元基数的2.56倍（按公式推算）。 -
医疗保险报销差异
医保个人账户划入金额与缴费基数相关。高基数者每月医保卡入账更多（如12800元按2%划入为256元，5000元仅100元），且部分地区的大病报销额度与缴费基数挂钩。 -
其他险种影响
失业保险金、工伤伤残补助等均按缴费基数核定，高基数者失业或工伤时可领取更高补偿。例如，失业保险金通常为基数的50%-80%。
总结：选择高基数虽增加当期支出，但长期看能提升社保福利水平；低基数适合短期减轻负担，但需权衡未来待遇。建议根据收入稳定性及长期规划合理选择基数档次。