在贵州黔西南，社保基数为20800元和5000元的主要区别体现在以下方面：
缴费金额差异
- 高基数（20800元）：每月社保总缴费金额会显著增加。例如，养老保险个人缴费比例为8%，则每月个人需缴纳1664元，而单位缴费比例通常为16%，即每月单位需缴纳3328元。
- 低基数（5000元）：个人和单位需要缴纳的社保费用相对较少。以5000元为基数，个人每月需缴纳400元，单位需缴纳800元。
养老金待遇差距
- 高基数：由于缴费基数高，个人账户积累的养老金金额也更多。退休后，每月领取的养老金将显著高于低基数的情况。
- 低基数：虽然缴费金额较少，但个人账户积累的养老金也相对较少，退休后每月领取的养老金较低。
医保报销与公积金影响
- 高基数：医保个人账户月入更多，例如20800元基数下，医保个人账户月入416元（2%比例），是低基数（100元）的4倍。高基数公积金缴存额（单位+个人）也更高。
- 低基数：医保报销上限较低，公积金缴存额也相对较低。
适用人群与政策限制
- 高基数：适用于工资水平较高的企业职工，需单位如实申报。高基数需符合当地社保基数上下限标准。
- 低基数：多为灵活就业人员或小微企业选择。同样需符合当地社保基数上下限标准，低基数需不低于当前下限。
总的来说，选择高基数（20800元）虽然意味着更高的缴费压力，但能够享受更高的社保待遇和更全面的保障，适合经济条件较好且对未来有较高期望的人群。而选择低基数（5000元）则缴费压力较小，但未来保障水平相对较低，适合当前经济压力较大或对社保福利需求不高的人群。