安徽新农合医保在上海就医的报销方式及比例如下，具体分为异地就医直接结算和回参保地报销两种情况：

一、异地就医直接结算（全国异地就医定点医疗机构）

1. 结算条件

   若上海医院为全国异地就医直接结算定点医疗机构，安徽新农合患者可按就医地医保目录和参保地支付比例直接结算，无需回参保地。

2. 所需材料

   • 住院证明

   • 身份证

   • 农合卡（证）

   • 入院登记时主动告知转诊身份。

二、回参保地报销（非定点医疗机构）

1. 报销比例

   • 镇卫生所：60%

   • 二级医院：40%

   • 三级医院：30%

   （普通住院费用）。

2. 大病报销

   • 一甲医院：无起付线

   • 二甲医院：75%-80%

   • 三甲医院：55%-60%

   （门诊统筹）。

3. 所需材料

   • 住院病历复印件

   • 费用清单

   • 住院发票

   • 身份证

   • 农合卡（证）。

三、特殊情形处理

• 长期居住人员 ：办理异地长期居住备案后，可直接在上海定点医疗机构就医报销，无需转诊。

• 门诊就医 ：异地普通门诊费用不予报销，仅限参保地医疗机构门诊。

注意事项 ：所有报销均需在医保有效期内办理，急诊等特殊情况除外。建议提前通过支付宝等平台办理异地就医备案，简化结算流程。