合作医疗在本省不同市是可以报销的，但需要提前进行异地备案，并选择医保定点医疗机构就医。参保人员在异地也可以享受基本医疗保险待遇，不过报销比例依据所在地区政策规定计算。

一、异地就医备案流程

• 参保人需提前向参合地经办机构申请办理跨省就医转诊。
• 通过线上平台或线下到参保地医保经办机构办理备案手续。
• 长期异地居住或工作人员需提供安置地户口、身份证、社保卡等材料。

二、选择定点医疗机构

• 备案完成后，参保人应在医保定点的医疗机构就医。
• 定点医疗机构名单可在国家医保服务平台APP上查询。
• 确保所选医院支持跨省直接结算以避免垫付全部费用。

三、报销比例和限额

• 不同级别的医疗机构报销比例有所差异，通常乡镇卫生院报销比例最高，三级医院最低。
• 具体报销比例需参照当地政策，可能因地方调整而变化。
• 注意了解年度报销限额及大病保险的相关规定。

四、报销所需材料

• 身份证、合作医疗证、病历复印件、住院结算单、费用清单等。
• 若为急诊情况，需补充紧急情况说明及相关证明文件。

合作医疗在本省不同市可以报销，但要遵循一定的条件和流程。确保完成必要的备案，并在指定的定点医疗机构接受治疗是关键。熟悉当地的报销政策和所需材料将有助于顺利报销医疗费用。如有疑问，建议咨询当地医保部门获取最新信息。