广东云浮社保基数6900元和5000元的主要区别体现在缴费金额、医保待遇、养老金影响以及适用的参保人群等方面，具体如下：

缴费金额差异

• 养老保险：以6900元为基数，个人缴费为552元（6900元 × 8%），单位缴费为1380元（6900元 × 20%）。以5000元为基数，个人缴费为400元（5000元 × 8%），单位缴费为1000元（5000元 × 20%）。选择6900元基数时，每月养老保险缴费总额会比选择5000元基数多出152元。
• 医疗保险：个人缴费部分，以6900元为基数约为138元（6900元 × 2%），以5000元为基数约为100元（5000元 × 2%），选择6900元基数时，每月医疗保险个人缴费多出约38元。
• 失业保险：个人缴费部分，以6900元为基数约为13.8元（6900元 × 0.2%），以5000元为基数约为10元（5000元 × 0.2%），选择6900元基数时，每月失业保险个人缴费多出约3.8元。
• 工伤保险和生育保险：由单位全额承担，因此不受缴费基数影响。

医保待遇区别

• 高基数参保人医保个人账户每月划入金额更多，例如，6900元基数约384元（138元 × 2），5000元基数约200元（100元 × 2），影响日常医疗支付能力。

养老金影响

• 养老金计算与缴费基数直接挂钩。假设同等缴费年限，按6900元基数退休后每月养老金可能比5000元基数高出800-1200元，长期累积差额可达数十万元。

灵活性与适用人群

• 5000元基数适合收入较低或灵活就业者，减轻短期负担；6900元基数更适合收入稳定、注重长期保障的人群。

在选择社保基数时，参保人应根据自己的经济状况、未来规划以及对社保待遇的期望来做出合理选择。