内蒙古阿拉善盟社保基数为12800元时，个人所得税的扣除情况需要根据具体的税率和速算扣除数来计算。根据2018年的个人所得税税率表，月薪在9000元至30000元之间的个人需要缴纳个人所得税。具体的税率和速算扣除数如下：
| 级数 | 累计预扣预缴应纳税所得额 | 税率(%) | 速算扣除数 |
|---|---|---|---|
| 1 | 不超过36000元的 | 3 | 0 |
| 2 | 超过36000元至144000元的部分 | 10 | 2520 |
| 3 | 超过144000元至300000元的部分 | 20 | 16920 |
| 4 | 超过300000元至420000元的部分 | 25 | 31920 |
| 5 | 超过420000元至660000元的部分 | 30 | 52920 |
| 6 | 超过660000元至960000元的部分 | 35 | 85920 |
| 7 | 超过960000元的部分 | 45 | 181920 |
由于您的社保基数为12800元，这属于第一级应纳税所得额，适用税率为3%，速算扣除数为0。每月应缴纳的个人所得税为：
应纳税额 = 应纳税所得额 × 税率 - 速算扣除数 应纳税额 = 12800元 × 3% - 0 应纳税额 = 384元
所以，内蒙古阿拉善盟社保基数为12800元时，每月应缴纳的个人所得税为384元。