关于罕见病医院排名，综合权威信息整理如下：
一、全国综合实力领先的罕见病医院
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中国医学科学院北京协和医院
- 全国三级甲等综合医院，集医疗、教学、科研于一体，国家疑难重症诊治指导中心，多学科协作优势显著，连续五年全国三级公立医院绩效考核排名第一。
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浙江大学医学院附属第二医院（浙大二院）
- 中国西医发源地，全国首家三级甲等医院，拥有国家级重点实验室和多个国家级平台，2023年复旦版医院专科声誉榜罕见病分榜第二名。
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北京大学第一医院（北大医院）
- 三级甲等综合医院，临床科学研究和成果转化领先，罕见病诊疗能力突出，全国三级公立医院绩效考核常居前10。
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福建医科大学附属第一医院
- 福建省重点医院，国家发改委、卫健委首批疑难病症诊治能力提升工程项目医院，罕见病协作网福建省牵头单位。
二、其他地区知名医院
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复旦大学附属儿科医院 ：在儿童罕见病诊疗方面具有较高声誉。
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四川大学华西医院 ：综合实力强，罕见病相关科室表现突出。
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华中科技大学同济医学院附属同济医院 ：神经内科等专科在罕见病诊疗中有一定优势。
三、区域特色医院
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首都医科大学北京儿童医院 ：儿科罕见病诊疗经验丰富。
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中国人民解放军总医院（301医院） ：多学科协作能力强，罕见病诊疗覆盖全面。
四、排名差异说明
不同榜单的排名依据可能包括科研能力、临床声誉、设备水平等，例如：
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复旦版医院排行榜 ：以声誉标化值和科研标化值综合评估，罕见病分榜中北京协和医院长期领先。
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区域医院专科排名 ：如华东地区专科声誉榜，北京大学第一医院罕见病专科排名第6。
五、患者就医建议
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优先选择综合实力强的医院 ：如北京协和、浙大二院等，多学科协作和科研资源更丰富。
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关注医院专科能力 ：部分医院在特定罕见病领域有突出表现，如北大医院、华西医院等。
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结合地理位置 ：偏远地区患者需提前了解当地医疗资源，可通过远程医疗或转诊机制获取专业帮助。
以上信息综合自权威医院官网及专业医疗排名平台，供参考。