企业职工医保余额不会清零。
企业职工医保，即城镇职工基本医疗保险，是一种国家法定的社会保障制度，旨在为职工提供基本的医疗保障。关于医保余额是否会清零的问题，我们可以从以下几个方面来理解：
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医保账户性质：企业职工医保账户属于个人账户，资金主要来源于个人缴费和单位缴费两部分。个人缴费部分全部计入个人账户，单位缴费部分的一部分也会划入个人账户。这些资金一旦进入个人账户，就属于个人所有，不会被清零。
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医保资金用途：医保个人账户的资金主要用于支付职工本人及其家属的医疗费用，包括门诊费用、住院费用以及在定点药店购买药品的费用等。这些费用的支付都是从个人账户中直接扣除的，不会影响账户余额。
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医保政策规定：根据国家医保政策规定，医保个人账户的资金是可以结转使用的，即当年未使用的资金可以结转到下一年度继续使用。这意味着，即使某个年度的医保资金没有使用完，也不会被清零，而是会自动结转到下一年度。
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特殊情况处理：在特殊情况下，如职工退休、死亡或移民出国等，医保个人账户的资金会根据相关政策规定进行处理。例如，职工退休后，个人账户的资金可以继续使用，直到用完为止；职工死亡后，个人账户的资金可以由其家属继承；职工移民出国后，个人账户的资金可以按规定进行退还。
企业职工医保余额不会清零，个人账户的资金属于个人所有，可以结转使用，并在特殊情况下根据政策规定进行处理。职工无需担心医保余额会清零的问题。