新农合本省跨市就医的报销流程如下：

1. 备案 ：

• 线上备案 ：可以通过微信搜索“国家异地就医备案”小程序，或下载“国家医保服务平台”APP，点击“异地就医备案申请”，根据提示填报个人信息进行备案。

• 线下备案 ：参保人或代办人携带患者身份证、两张一寸彩色照片、新农合医疗证到县合管办办理转诊备案手续。

2. 选择定点医疗机构 ：

• 通过国家医保服务平台查询可供选择直接结算的异地联网定点医疗机构。确保选择的医疗机构是可以跨省结算的定点医疗机构。

3. 报销 ：

• 联网结算医院报销 ：在全国联网结算医院发生符合政策规定的住院医疗费，已办理转诊备案手续的，个人首先负担10%，剩余部分按照参保地三级医院报销政策审核结算；未办理转诊备案手续的，个人首先负担40%，剩余部分按照参保地三级医院报销政策审核结算。

• 非联网结算医院报销 ：出院后，凭患者本人身份证（或户口本）、新农合医疗证、病历复印件、住院结算单、住院费用清单、转诊备案手续等资料到参合地经办机构报销。

4. 特殊情况处理 ：

• 如果因特殊情况不能实时完成住院报销，需要就医医院开具一份《跨省就医转诊患者出院未享受即时结报服务说明》，并回到参合地报销。

• 异地报销时，患者需提交完整的医疗费用票据和报销材料，由新农合管理部门进行审核。审核通过后，报销费用将打入患者指定的银行账户或通过现金方式发放。

建议：

• 尽量选择可以跨省直接结算的定点医疗机构，以减少个人垫付和跑腿的麻烦。

• 备案时尽量选择线上方式，方便快捷。

• 保留好所有相关材料和证明文件，以便在报销时能够顺利进行。