合作医疗在以下几种情况下通常不能报销：
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非定点医疗机构就诊：合作医疗通常要求在指定的医疗机构就诊，如果患者在非定点医疗机构接受治疗，相关费用可能无法报销。
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超出报销范围的医疗服务：合作医疗有明确的报销范围，包括药品、诊疗项目和医疗服务设施等。如果患者接受的医疗服务超出了这个范围，例如某些进口药品或特殊治疗，费用可能无法报销。
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未按时缴费：合作医疗通常需要患者按时缴纳费用，如果患者未按时缴费，在缴费之前发生的医疗费用可能无法报销。
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第三方责任事故：如果医疗费用是由于第三方责任事故引起的，例如交通事故或工伤事故，合作医疗可能不会报销相关费用，因为这部分费用应由第三方承担。
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违法犯罪行为：如果医疗费用是由于患者的违法犯罪行为引起的，例如斗殴或吸毒，合作医疗可能不会报销相关费用。
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其他特殊情况：除了上述情况外，还有一些特殊情况可能导致合作医疗无法报销医疗费用，例如患者在国外接受治疗或患者属于合作医疗的免责人群等。
总结：合作医疗为患者提供了一定的医疗费用保障，但在特定情况下可能无法报销相关费用。患者在就诊前应了解合作医疗的报销政策和要求，以便合理安排医疗费用。如有疑问，建议咨询合作医疗的管理机构或相关部门。