根据我国现行劳动法律法规，不加班扣全勤奖的合法性需结合具体情况分析：
一、不加班扣全勤奖的违法性
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法律依据
根据《劳动法》第四十一条规定，用人单位安排加班需经劳动者同意，且不得以补休或工资形式替代。若用人单位以不加班为由扣除全勤奖，可能涉及以下违法情形：
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未支付加班费却扣除全勤奖（《劳动法》第四十四条）；
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以不加班为由扣除绩效或福利，但未提供合法补偿。
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例外情况
若劳动者明确同意不加班（如双方有书面协议或口头约定），则公司可依据约定扣除全勤奖或绩效，但需注意：
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违约责任需明确约定；
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扣除金额不得超过劳动者当月工资的20%。
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二、维权建议
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保留证据
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留存加班申请记录、考勤记录、工资条等；
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收集公司关于加班工资计算标准的文件。
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协商解决
首先与用人单位沟通，要求补发加班工资或调整奖惩机制。若公司拒绝合理诉求，可进入下一步。
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申请仲裁
向当地劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请，需提供：
- 仲裁申请书、身份证复印件、证据清单及用人单位工商信息。
三、注意事项
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绩效考核与奖惩机制 ：全勤奖属于用人单位自主管理的薪酬组成部分，但不得违反劳动法规定。若公司规章制度中存在“不加班扣全勤”的条款，该条款可能被认定为无效。
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地域差异 ：部分城市（如北京）对用人单位工资发放时间有明确限制（如工资需在解除劳动合同时发放），若公司存在工资延迟发放情况，可能涉及其他法律问题。
不加班扣全勤奖的合法性需以劳动者是否同意加班及公司规章制度是否合法为判断依据 ，建议通过协商或法律途径维护自身权益。