非结核分枝杆菌病部分患者可以根治，但存在一定难度，受多种因素影响，具体如下：

• 感染类型：不同类型的非结核分枝杆菌病治愈率有所不同。例如，堪萨斯分枝杆菌肺病的治愈率与结核病相当，而胞内分枝杆菌和鸟分枝杆菌肺病的治愈率约为 60%-80%，脓肿分枝杆菌肺病治愈率仅 30%-50%。
• 病情严重程度：如果病情较轻，病变范围局限，没有累及多个器官或系统，通过及时、规范的治疗，根治的可能性较大。但如果是播散性非结核分枝杆菌病，或者已经出现了严重的并发症，如肺脓肿、脑膜炎等，治疗难度会显著增加，根治的可能性相对较小。
• 患者整体健康状况：患者的年龄、基础疾病以及免疫功能等因素对治疗效果有重要影响。一般来说，年轻、免疫功能正常、没有其他严重基础疾病的患者，身体对药物的耐受性和治疗反应较好，根治的机会更大。而老年人、患有慢性呼吸道疾病、免疫缺陷疾病（如艾滋病）或正在使用免疫抑制剂的患者，身体抵抗力较差，治疗过程中容易出现药物不良反应，且感染容易复发，根治较为困难。
• 治疗方式：采用合理的治疗方案是提高治愈率的关键。非结核分枝杆菌病的治疗主要根据药敏试验结果，常规采用 4-5 种药物联合治疗，对于免疫力低下者，还需联合使用提高免疫力的药物。手术治疗可作为辅助疗法，适用于内科治疗无效或失败及复发性与顽固性咯血的患者，或皮肤及软组织感染时对病变组织进行切除等。如果患者能够严格按照医生的建议，规律服药，完成足够的疗程，根治的可能性会明显增加。但如果患者依从性差，不按时服药或自行停药，很容易导致治疗失败或疾病复发。

总体而言，非结核分枝杆菌病虽然治疗具有挑战性，但通过早期发现、准确诊断、规范治疗以及患者的积极配合，许多患者可以得到有效治疗，达到临床治愈。临床治愈的标准通常是完成抗非结核分枝杆菌的治疗疗程，临床症状改善，连续 3 次痰细菌培养阴性，每次间隔至少 1 个月。不过，仍有部分患者可能会复发，需要长期随访和监测。