根据最新政策，合肥居民医保在上海住院是可以使用的，具体报销规则如下：
一、异地就医备案要求
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备案方式
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办理异地长期居住备案（需提供异地身份证、户口本或暂住证等材料），备案后在上海的定点医疗机构可直接结算费用。
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临时外出就医（如转诊、急诊等）需在就医地办理转诊备案手续。
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报销比例
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住院费用 ：
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省三甲医院：70%（起付线1000元）
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市三甲医院：75%（起付线700元）
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普通门诊 ：二级及以上医院60%（年度累计800元起付线）。
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二、报销流程
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直接结算
- 完成异地就医备案后，持医保卡、身份证、出院小结、发票等材料，在上海定点医疗机构直接结算费用。
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手工报销
- 未办理备案的临时外出就医，需先垫付费用，回合肥后携带材料申请手工报销。
三、注意事项
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异地长期居住人员 ：办理备案后无需每次就医备案，直接结算。
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退休人员 ：需确认是否已办理异地长期居住备案。
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报销限额 ：普通门诊年度最高报销2000元，具体以参保地政策为准。
四、特殊情况处理
- 若因特殊原因无法直接结算，可先垫付费用，再携带材料回合肥医保经办机构申请手工报销。
以上信息综合了医保政策及长三角地区异地就医结算的协同机制，确保参保人员在上海就医时能够及时获得医疗保障。