在增值税申报过程中，附表二是用于记录进项税额的详细情况的重要表格。对于计算抵扣的金额如何填写到附表二中，这取决于具体的业务类型和发票种类。
计算抵扣的情形
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农产品收购或销售发票：当企业从农业生产者个人手中收购自产免税农业产品时，会开具农产品收购发票；而农业生产者单位销售自产农产品时，则开具农产品销售发票。这两种发票都属于普通发票范畴，并且需要按照买价和相应的扣除率（通常为9%，特殊情况为10%）来计算进项税额 。
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通行费电子普通发票：如果纳税人支付了道路通行费并获得了带有“通行费”字样的增值税电子普通发票，那么可以根据票面上注明的税率和税额直接进行抵扣。但是，对于纸质的通行费发票，特别是那些非ETC支付方式获得的发票，只能对过桥、过闸费用进行计算抵扣 。
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旅客运输服务扣税凭证：包括取得注明旅客身份信息的铁路车票在内的旅客运输服务扣税凭证，也需要通过特定公式计算进项税额后填入附表二中的相应栏位 。
如何填写附表二
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农产品收购或销售发票：根据规定，企业应将计算得出的进项税额填入《增值税纳税申报表附列资料（二）》（本期进项税额明细）第6栏“农产品收购发票或者销售发票”栏内 。如果是农产品深加工企业，并选择了加计扣除，则需将加计扣除部分填入第8a栏“加计扣除农产品进项税额”。
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通行费电子普通发票：这类发票可以直接勾选确认后申报抵扣，其金额与税额分别对应填写在附表二的相关栏次中，类似于增值税专用发票的处理方式 。对于无法直接抵扣的纸质通行费发票，如过桥、过闸费用，则需按规定的公式计算出可抵扣的进项税额，并将其填入附表二第8b栏“其他”栏内 。
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旅客运输服务扣税凭证：若取得的是增值税电子普通发票，应直接依据发票上注明的不含税金额及税额填写到附表二的相关栏位 。而对于铁路车票等需通过公式计算进项税额的情况，则应在计算完成后，将不含税金额和计算得到的税额分别填写至附表二对应的栏目中。
在填写附表二时，确保所有数据准确无误至关重要。无论是直接来源于发票的信息还是通过公式计算得出的结果，都需要仔细核对以保证报表的真实性和准确性。同时，随着税务政策的变化，企业应及时更新自身的财务知识体系，以便更好地遵守最新的税收法规要求。
请注意，以上信息基于当前已知的数据提供，具体操作时还需参照最新的税务指南和地方税务局的具体要求。如果您遇到复杂的税务问题，建议咨询专业的会计师或税务顾问。