1. ​运营成本高
   合作社的日常运营需要承担场地、人力等成本，这些费用通常由成员承担，可能影响农民收入和参与积极性。

2. ​决策与利益分配不公平
   部分合作社存在决策权集中于少数人、利益分配不均的问题，普通社员参与度低，甚至出现“空壳化”现象，导致资源分配失衡。

3. ​规模与范围受限
   受限于资金、土地流转等因素，合作社难以扩大规模，无法满足所有成员需求，部分合作社因土地租金上涨或流转困难而被迫调整计划。

4. ​管理不规范
   缺乏科学的管理制度和规范流程，财务监管失效（如白条入账、分红模糊）、章程流于形式等问题突出，影响合作社的稳定性和公信力。

5. ​人才与资金短缺
   成员多为农民，文化素质和专业技能不足，难以吸引高素质人才；资金来源依赖成员股金和政府扶持，融资渠道狭窄，制约发展。

6. ​品牌与质量安全问题
   品牌意识薄弱，产品附加值低，同质化竞争严重；部分合作社存在农药残留超标等质量安全问题，损害消费者信任和合作社声誉。

7. ​抗风险能力弱
   缺乏有效的风险管理机制，易受自然灾害、市场波动等影响，且农业保险覆盖率低，进一步加剧经营风险。

8. ​政策执行与外部环境制约
   部分地区存在政府干预过多或支持不足的情况，审批流程繁琐、政策落地难，同时市场准入壁垒和隐性限制也阻碍合作社发展。

总结：农村合作社需通过规范管理、引入人才、拓宽融资渠道、强化品牌建设等措施提升竞争力，同时政府应加大扶持力度，优化政策执行，助力合作社健康发展。