南京市员工流产申请生育津贴的流程如下：

1. 申请条件 ：

• 必须是南京市参加生育保险的女职工。

• 生育或流产前，用人单位需连续缴纳生育保险费满10个月。若生育或流产时缴费不足10个月，生育津贴先由用人单位垫付，待用人单位在职工生育或流产次月起1年内累计缴费满10个月后，再向社会保险经办机构申请拨付生育津贴。

• 生育或流产的情形必须符合国家和南京市的计划生育政策规定。

2. 申请材料 ：

• 《南京市生育保险待遇申报表》并加盖单位公章（如为灵活就业人员无需盖章）。

• 结婚证原件。

• 《独生子女证》原件（生育第二胎需提供《批准再生育一个孩子生育证》原件及复印件）。

• 出院记录复印件（门诊流（引）产手术提供病历及病假条）。

3. 申请流程 ：

• 线下申请 ：每月1~10日（遇节日顺延），由单位经办人携带申请材料到市医保中心办理生育津贴、一次性营养补助费的申领。医保中心审核材料后，确认符合享受生育保险待遇的，按相关规定将生育津贴、一次性营养费划入参保单位账户。

• 线上申请 ：通过“南京医保”微信公众号、南京医保网上办事大厅、“我的南京”APP或“江苏医保云”APP申请生育津贴。按要求上传出院小结照片，选择报销类型为生育津贴，输入手机号码后，点击申请报销即可。审核通过后，生育津贴将直接发放至个人银行账户或单位账户。

4. 津贴计算 ：

• 生育津贴总额 = 单位上年度月平均工资 ÷ 30天 × 产假天数。

• 单位平均工资低于南京市社平工资60%：按社平工资60%计算；高于300%：按300%封顶。

• 产假天数详解：顺产/单胎98天（难产增加15天，多胞胎每多1个加15天）；奖励假：符合条件可享60天生育假（需单位确认）；特殊情况：妊娠满4个月引产按42天算，不满4个月按15天算。

5. 到账时间 ：

• 材料齐全的情况下，20个工作日内完成审核，生育津贴将一次性打入个人账户。

建议：

• 确保在生育或流产前，用人单位已按规定连续缴纳生育保险费满10个月。

• 提前准备好所有申请材料，确保材料齐全，以便顺利申请生育津贴。

• 选择线上或线下申请方式，根据个人便利性进行选择。